Do zakresu działania Departamentu Kontroli, Skarg i Wniosków należy:

1. prowadzenie kontroli w komórkach organizacyjnych Ministerstwa, organach podległych lub nadzorowanych przez Ministra i urzędach obsługujących te organy oraz w jednostkach organizacyjnych podległych Ministrowi lub przez niego nadzorowanych, w tym prowadzenie kontroli przestrzegania procedur udzielania zamówień publicznych orz kontrola udzielania, wykorzystania i rozliczania dotacji przekazanych z budżetu Ministra na zadania zlecone;
2. przeprowadzanie kontroli organizacji i warunków pracy samorządowych kolegiów odwoławczych;
3. badanie prawidłowości przeprowadzonego postępowania wyjaśniającego w celu ustalenia okoliczności faktycznych i prawnych uzasadniających odwołanie prezesa samorządowego kolegium odwoławczego;
4. badanie prawidłowości przeprowadzonego postępowania wyjaśniającego i postępowania dyscyplinarnego w celu ustalenia okoliczności faktycznych i prawnych uzasadniających ukaranie członka samorządowego kolegium odwoławczego;
5. koordynacja kontroli prowadzonych przez komórki właściwe w sprawach kontroli w organach i jednostkach organizacyjnych podległych Ministrowi lub przez niego nadzorowanych;
6. analiza i ocena form kontroli prowadzonych przez organy i jednostki organizacyjne podległe Ministrowi lub przez niego nadzorowane;
7. prowadzenie spraw związanych:
   1. z przyjmowaniem oraz rozpatrywaniem skarg i wniosków w Ministerstwie w zakresie właściwości Ministra, w tym z obsługą przyjęć obywateli przez Ministra lub innego przedstawiciela kierownictwa Ministerstwa,
   2. z załatwianiem skarg i wniosków oraz koordynowaniem i nadzorem załatwiania skarg i wniosków przez komórki organizacyjne Ministerstwa oraz organy i jednostki organizacyjne podległe Ministrowi lub przez niego nadzorowane;
8. współpraca z organami kontroli upoważnionymi do przeprowadzania kontroli w Ministerstwie, w tym koordynowanie udzielania odpowiedzi i monitorowanie realizacji wniosków pokontrolnych;
9. koordynacja spraw kierowanych do Ministerstwa w związku z realizowaną działalnością lobbingową;
10. prowadzenie spraw w zakresie monitorowania rasizmu i ksenofobii oraz podejmowanie działań mających na celu przeciwdziałanie tym zjawiskom.

Jednostki podrzędne:

• Wydział Analiz i Strategii Kontroli
• Wydział Kontroli Aministracji Publicznej
• Wydział Kontroli Służb Mundurowych
• Wydział Skarg i Wniosków
• Zespół Monitorowania Rasizmu i Ksenofobii
• Samodzielne Stanowisko