Do zakresu działania Departamentu Wyznań Religijnych oraz Mniejszości Narodowych i Etnicznych należy:

1. prowadzenie spraw:
   1. z zakresu stosunków między Państwem a kościołami i związkami wyznaniowymi,
   2. Funduszu Kościelnego oraz współdziałanie z Zakładem Ubezpieczeń Społecznych w sprawach ubezpieczeń duchownych,
   3. rejestru kościołów i innych związków wyznaniowych,
   4. mniejszości narodowych i etnicznych oraz języka regionalnego,
   5. Urzędowego Rejestru Gmin, w których używany jest język pomocniczy,
   6. Rejestru gmin, na których obszarze używane są nazwy w języku mniejszości;
2. obsługa organizacyjno-techniczna:
   1. komisji do spraw zwrotu mienia Kościoła Katolickiego w Rzeczypospolitej Polskiej oraz innych kościołów i związków wyznaniowych,
   2. Komisji Wspólnej Przedstawicieli Rządu i Konferencji Episkopatu oraz wspólnych Komisji Rządu i władz innych kościołów i związków wyznaniowych,
   3. Komisji Wspólnej Rządu i Mniejszości Narodowych i Etnicznych;
3. zastępstwo procesowe Ministra przed sądami administracyjnymi w sprawach wykorzystania dotacji celowych przez mniejszości narodowe i etniczne oraz społeczność posługującą się językiem regionalnym.

Jednostki podrzędne:

• Samodzielne Stanowisko do Wykonywania Zadań dot. Monitorowania Realizacji Programów na rzecz Mniejszości Narodowych i Etnicznych
• Wydział Funduszu Kościelnego
• Wydział Kościołów i Związków Wyznaniowych
• Wydział Mniejszości Narodowych i Etnicznych
• Zespół Obsługi Kancelaryjno-Biurowej